Le CCOS est administré par un directeur et un conseil d’administration précidé par le Recteur, président de l’Assemblée de l’Université. Il est ainsi organisé:
- Services Administratifs
- Division Finances
- Comptabilité matières
- Services Infrastructures et Systèmes d’Information (SISI) avec (3) divisions :
- Division Systèmes d’Information (DSI) ;
- Division des Infrastructures et Services (DIS) ;
- Division Maintenance et Logistique (DML)
- Service Enseignement, Formation et Recherche
- Division Ingénierie et Affaires Pédagogiques